• بروتوكولات التعاون: قامت الهيئة بتوقيع العديد من بروتوكولات التعاون مع الجهات المحلية مثل: الجهاز المركزى للتعبئة العامة والإحصاء، هيئة تنمية جنوب الصعيد، المعهد القومي للبحوث الفلكية والجيوفيزيقية.
  • أطر التعاون الاستراتيجي مع الجهات الدولية: شاركت الهيئة في صياغة العديد من الأطر الإستراتيجية للتعاون بين مصر وعدد من المنظمات الدولية مثل البنك الدولي للفترة (2023 – 2027)، الأمم المتحدة للتعاون من أجل التنمية المستدامة للفترة (2023 – 2027)، بنك التنمية الافريقي للفترة (2026-2022).